小麦赤霉病是典型的气候型病害，可防不可治，防治时要掌握在小麦扬花初期（扬花株率5%—10%）全面用好第一次药，隔5—7天再施用第二次药。若扬花期遇阴雨天气时可提前至齐穗期施用第一次药，药后6小时内遇雨要及时补治，确保所有小麦齐穗扬花初期全面、足量用药一遍。第一次可选用抑制赤霉病孢子萌发的氰烯菌酯、氟唑菌酰羟胺等药剂，第二次可选用抑制菌丝生长的丙硫菌唑、叶菌唑以及氰烯菌酯等药剂，第二次用药严禁使用甲氧基丙烯酸酯类药剂（如吡唑醚菌酯、嘧菌酯）。注意轮换用药，停用多菌灵、甲基硫菌灵单剂及复配剂。